²⁰²⁶/₅.₁₂ 科技前沿 | 三羧酸循环调控染色质重塑,决定多能干细胞命运转变
发布日期:2026-05-20

再生医学浪潮翻涌,多能干细胞疗法凭借其巨大的应用潜力与不断涌现的突破性成果,正跃升为全球医疗领域最炙手可热的赛道。

近来,这一前沿领域传来振奋人心的进展——不仅为难治性疾病的治疗开辟了全新路径,更给整个再生医学的发展注入了强劲动能,让攻克疑难病症的希望愈发清晰。

Cell Stem Cell | 三羧酸循环调控染色质重塑,决定多能干细胞命运转变

近日,国际顶级期刊《Cell Stem Cell》在线发表了一项由哥本哈根大学Novo Nordisk Foundation干细胞医学中心(reNEW)牵头完成的突破性研究。

该团队通过多组学技术系统解析了三羧酸循环(TCA cycle)的动态重编程,在胚胎干细胞退出多能状态、完成命运转变过程中的核心调控作用,首次完整构建了 “代谢 - 染色质 - 细胞命运” 的耦合调控框架,为干细胞分化调控、再生医学应用与疾病机制研究提供了全新的理论支撑。

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长久以来,学界聚焦于转录因子调控网络对细胞命运的决定作用,却始终未能完全解答:细胞内的代谢活动,究竟如何在分子层面串联起染色质状态的重塑,最终驱动细胞命运的不可逆转变?

研究团队以小鼠胚胎干细胞ESC向EpiLC的转变为核心模型,整合了¹³C 稳定同位素示踪代谢组学、转录组测序、组蛋白翻译后修饰定量分析等多维度技术,同时构建了IDH1可诱导降解系统,精准追踪了干细胞退出多能性过程中,TCA循环的动态变化、碳流分配规律,及其对表观遗传与细胞命运的调控作用。

01 IDH1:连接细胞质与线粒体代谢的核心调控节点

异柠檬酸脱氢酶1(IDH1),是本次研究中锁定的核心靶点。作为沟通细胞质与线粒体代谢网络的关键分子,IDH1的功能完整度,直接决定了细胞内的碳流分配方向。

研究发现,当诱导IDH1降解后,干细胞内的碳流代谢出现显著紊乱,直接导致乙酰辅酶A的生成严重受限。而乙酰辅酶A正是组蛋白乙酰化修饰的核心底物,其供给不足会引发全基因组范围的组蛋白乙酰化水平下降,直接改变染色质的开放状态 —— 原本维持多能性的基因位点无法正常转录,而分化相关的基因程序也无法有序启动,最终导致干细胞退出多能性的进程完全受阻。

空间调控的TCA重连机制支撑着胚胎的植入过程

02 双代谢通路协同:维持干细胞多能性的核心代谢网络

研究团队进一步厘清了多能干细胞维持表观遗传可塑性的代谢基础:在原始态多能干细胞中,谷氨酰胺代谢的还原性羧化途径,与丙酮酸循环形成了高效的协同代谢网络。

这两条代谢支路的协同作用,为细胞内乙酰辅酶A的持续稳定供给提供了核心支撑,正是这套代谢体系,维持了干细胞内高水平的组蛋白乙酰化、开放的染色质构象,以及多能性基因的稳定表达。一旦这套协同网络被干扰,干细胞的表观遗传可塑性会急剧下降,不仅无法正常完成多能性退出的进程,还会出现分化程序偏移、细胞命运走向异常等问题。

还原型谷氨酰胺羧化作用与丙酮酸循环相互协作,以维持组蛋白乙酰化水平的稳定

03 首次完整构建 “代谢 - 染色质 - 细胞命运” 耦合调控框架

基于完整的实验证据,研究团队提出了全新的细胞命运调控理论:代谢通量的重编程,是驱动干细胞命运转变的上游核心事件。

其完整调控逻辑为:

TCA循环相关代谢通路重编程→关键代谢物(乙酰辅酶 A)的胞内供给水平改变→全基因组组蛋白修饰景观重塑→染色质开放状态发生全局性变化→多能性维持与分化启动的基因表达网络重构→细胞命运发生不可逆转变。

这一框架彻底打通了 “代谢调控 - 表观遗传 - 基因表达 - 细胞命运” 的完整链条,证明了代谢重编程并非细胞命运转变的副产物,而是决定干细胞命运走向的核心调控者。

丙酮酸循环能够促使细胞及时进入发育阶段的多能状态并进行分化

总结

随着代谢组学与表观遗传学交叉领域研究的持续深入,学界对细胞生命活动核心调控网络与分子机制的解析不断深化。该研究进一步证实,细胞代谢并非细胞生命活动的下游辅助环节,而是调控细胞命运决定进程的核心上游调控枢纽。未来,随着对代谢表观调控机制的系统认知不断完善,有望实现对干细胞命运的精准定向调控,为再生医学的创新发展与人类健康保障带来关键性突破。

 

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